More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1073 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  315  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 175 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 168 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  32.59 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  29.66 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  26.35 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  31.25 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  25.85 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 304 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  29.41 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 171 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  24.29 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  28.36 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  25.93 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  27.61 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>