162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2834 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  307  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  46.43 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  45.22 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  36.64 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  34.27 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  30.3 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  25.68 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  30.32 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  24.34 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  30.15 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 304 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.81 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  23.13 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  25.6 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  25.85 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0059  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0308587  hitchhiker  0.00000975355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  33.68 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 314 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>