289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1042 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 160 aa  323  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 148 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  46.32 
 
 		 151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  40.74 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 185 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 138 aa  94.4  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  32.89 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 304 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  39.42 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 304 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  28.68 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  32.31 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  28.03 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  28.03 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  25.34 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>