More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5157 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  86.06 
 
 		 165 aa  290  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  82.94 
 
 		 170 aa  257  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  69.13 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 144 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  49.67 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 148 aa  94.4  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  36.43 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  36.76 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  33.64 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  26.28 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  29.91 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  29.66 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 183 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>