More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1847 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.78 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.53 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.25 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.25 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.25 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.25 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  29.25 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  31.13 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  34.34 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  36.5 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.15 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 137 aa  51.2  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>