More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0162 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  348  3e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  98.81 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  51.7 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  29.53 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  29.53 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  29.53 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  26.97 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  26.92 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  27.63 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  25.66 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  25.66 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  25.49 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  25.49 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  25.49 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  27.21 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  25.49 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.2 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  26.32 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  26.32 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  26.32 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  26.32 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  26.32 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  25.49 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  26.32 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  26.32 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  26.32 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  26.32 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  33.71 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  34.88 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  28.57 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  27.48 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  26.11 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 153 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  30.21 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  27.61 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  23.35 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>