More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2676 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 164 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  42 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  40.67 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 151 aa  107  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  36.81 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  41.26 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  28.47 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  32.24 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.73 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.73 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.57 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  27.73 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  32.37 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  27.73 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.73 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  27.73 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  33.33 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  33.58 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  29.41 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  37.84 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>