225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2693 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 143 aa  290  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  30.6 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  33.94 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  32.73 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.39 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  28.7 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 176 aa  50.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 163 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 162 aa  50.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  29.71 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.83 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.79 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.79 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.79 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.03 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.03 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.79 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.79 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.03 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.03 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.03 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.03 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.03 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.03 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  26.89 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  24.11 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  24.11 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  24.11 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  27.94 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  33.64 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  32 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>