172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0223 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  318  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  68.45 
 
 		 169 aa  213  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 157 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  64.74 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  64.74 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  40.56 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 		 148 aa  84  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  39.16 
 
 		 204 aa  84  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  33.1 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  39.81 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  31.34 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  32.84 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  29.63 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 172 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0782  putative helix-turn-helix transcriptional regulator  39.66 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  25.49 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  22.47 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  33.75 
 
 		 292 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  32.11 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  23.13 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  29.41 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  25 
 
 		 161 aa  43.9  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 158 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  35.71 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  20.9 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  31.09 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  32 
 
 		 261 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>