115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1408 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  45.33 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  46.92 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.24 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  35.56 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  32.14 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  30 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.7 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  27.71 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.52 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  31.65 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  26.83 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.77 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  30.77 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  27.36 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  28.46 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  28.04 
 
 		 167 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 162 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 155 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.09 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>