More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0013 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  286  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  31.82 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0817  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  39.73 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  24.55 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 159 aa  50.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 303 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  24.83 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  29 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 219 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 200 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.36 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  26.47 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  21.57 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  23.71 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  35.06 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  23.61 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>