More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0131 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 138 aa  259  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  51.85 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  54.74 
 
 		 187 aa  118  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.15 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  37.5 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.82 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  39.8 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  26.72 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.17 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  33.96 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  25.86 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  32.17 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  26.77 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  26.77 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 167 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  45.35 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  24.63 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>