More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3846 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  86.86 
 
 		 138 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  57.97 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  57.97 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  53.62 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  28.68 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  36.17 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  36.17 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  33.03 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.72 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  27.72 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  37.66 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.73 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  35.11 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  35.11 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0511  transcriptional regulator  31 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 165 aa  48.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  36.11 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  29.46 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>