More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0776 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 187 aa  355  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  54.74 
 
 		 138 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  46.43 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 		 138 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  45.78 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  23.26 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  39.29 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  38.02 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  36.69 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30 
 
 		 312 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.38 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.4 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 136 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  35.11 
 
 		 153 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  37.38 
 
 		 287 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  35.77 
 
 		 324 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  47.3 
 
 		 162 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 139 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  37.21 
 
 		 146 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.15 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  46.55 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  29.77 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>