296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3151 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
193 aa  398  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  49.71 
 
 
233 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
203 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  40.98 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3152  hypothetical protein  32.74 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0841  MarR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0989583  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  36.03 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  31.33 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
146 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
146 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
146 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
146 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 
296 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  33.65 
 
 
292 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  31.67 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
146 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
145 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
144 aa  51.6  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
157 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
147 aa  51.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
143 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  41.1 
 
 
324 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  31.82 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  31.82 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.82 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
147 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  24.65 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.82 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
145 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
150 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
156 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
160 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 
176 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
160 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
160 aa  47.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
160 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
164 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
147 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
160 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
139 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
139 aa  47.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
155 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  36.46 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  27.05 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  34.48 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 
145 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.68 
 
 
146 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
144 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
159 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.68 
 
 
146 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.68 
 
 
146 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 
159 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.68 
 
 
146 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
155 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
168 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.68 
 
 
146 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>