169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1920 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  49.71 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  47.51 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  44.35 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3152  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0841  MarR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0989583  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 296 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  30.43 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 154 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 165 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 162 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 157 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 146 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 146 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 156 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 144 aa  49.3  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 166 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 143 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 165 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 169 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 159 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 180 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 171 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 156 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 171 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 138 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 136 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 136 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 136 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 166 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3525  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 155 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 144 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 155 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  23.72 
 
 		 203 aa  45.4  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  23.48 
 
 		 154 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 164 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 140 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 141 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 159 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  27.69 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>