More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0453 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  335  9.999999999999999e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  31.95 
 
 
233 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  33.61 
 
 
206 aa  60.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  30.91 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.56 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
151 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
151 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
151 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 
147 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  23.78 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
142 aa  50.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
148 aa  50.8  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
147 aa  50.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
144 aa  50.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  27.93 
 
 
147 aa  50.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  26.67 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
296 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  27.84 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
193 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
195 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  28.12 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
185 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
213 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
171 aa  48.1  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
219 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
150 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
197 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
182 aa  47.8  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  31.46 
 
 
213 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 
139 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  30.77 
 
 
292 aa  47.4  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  26.32 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
145 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  26.74 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  30.84 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  27.86 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  32.14 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  26.77 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 
187 aa  45.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  34.21 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  27.19 
 
 
187 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>