More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1679 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  99.31 
 
 		 145 aa  289  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  65.56 
 
 		 171 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  65.56 
 
 		 171 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  62.5 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 174 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 184 aa  155  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  33.86 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.03 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.77 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  31.5 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  31.69 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 296 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 193 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  28.03 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 193 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  31.25 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  31.25 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  31.25 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  31.25 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>