More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0037 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  36.08 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  27.13 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  33.08 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  21.85 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  21.85 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  31.91 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  27.73 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  24.07 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  25.2 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  31.78 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  22.83 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  22.83 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  26.45 
 
 		 324 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 151 aa  50.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  21.85 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>