294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0017 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0511  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  28.07 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  29 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  29.79 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  32.94 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  22.32 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  29.33 
 
 		 313 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  22.32 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  29.79 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  21.7 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  23.14 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  22.32 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  21.7 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  22.52 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>