More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1224 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  309  7.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  67  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  35.71 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  25.9 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 164 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  21.31 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.68 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  24.79 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.68 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.46 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  28.46 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  23.74 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  23.74 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  24.3 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  24.63 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  21.58 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  30.1 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  22.63 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  32.89 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  39.53 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.19 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>