54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1259 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  43.07 
 
 		 180 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  24.31 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  24.64 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 177 aa  50.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0987  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000387404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  23.71 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  22.52 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  23.57 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  30.38 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  29.41 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  21.37 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>