More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2133 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  71.97 
 
 		 140 aa  199  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 144 aa  66.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  27.2 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  43.33 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  34.74 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  33.61 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  34.02 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  32.99 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  43.21 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  36.61 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.19 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.19 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.42 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>