More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1028 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  337  4e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  31.62 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  32.35 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  27.74 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  35.23 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  25.23 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  27.52 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0059  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0308587  hitchhiker  0.00000975355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>