More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4899 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  85.71 
 
 		 161 aa  275  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  51.95 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 157 aa  117  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  40.62 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.57 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  36.23 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.57 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.03 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  29.33 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  22.66 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.9 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.15 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  25.32 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  24.31 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.98 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  28.03 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>