More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3276 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  337  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 174 aa  227  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  67.83 
 
 		 157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  59.63 
 
 		 171 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  59.63 
 
 		 171 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  67.86 
 
 		 145 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  58.22 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 150 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 		 149 aa  84.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  32.32 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  31.58 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.35 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  30.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  33.94 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 303 aa  57.4  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  34.04 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  34.04 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  34.04 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  34.04 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  34.04 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  27.78 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 128 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>