161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2075 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  292  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  51.59 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  46.34 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  46.28 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 214 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  31.82 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  33.09 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  33.64 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  29.32 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  27.82 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.91 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  26.15 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  29.5 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  32.76 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.58 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  28.81 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  18.12 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  30.67 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  36.63 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1124  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  27.21 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4641  hypothetical protein  31.97 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>