More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4187 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  317  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  91.08 
 
 		 158 aa  291  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 		 150 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 		 150 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 		 150 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  30.95 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  29.17 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  24.84 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.56 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.96 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  27.01 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  24.43 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  28.87 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  24.03 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  29.91 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  30.86 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  25.78 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>