More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3065 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  294  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  92.52 
 
 		 147 aa  273  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  41.55 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  27.82 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  27.82 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29.5 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  39.09 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.35 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  39.09 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.23 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.82 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  33.64 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  30.93 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 175 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 183 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>