More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1806 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  97.28 
 
 
147 aa  295  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  97.28 
 
 
147 aa  295  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  97.28 
 
 
147 aa  295  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  97.28 
 
 
147 aa  295  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  97.28 
 
 
147 aa  295  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  97.28 
 
 
147 aa  295  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  96.6 
 
 
147 aa  294  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  96.6 
 
 
147 aa  293  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  95.92 
 
 
147 aa  292  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
136 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 
136 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 
136 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  43.44 
 
 
136 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 
136 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 
136 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0059  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0308587  hitchhiker  0.00000975355 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
136 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
136 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.46 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.46 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.46 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.46 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.46 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.46 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  36.46 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  36.46 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.82 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.42 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  35.78 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.42 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  30.48 
 
 
157 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 
157 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.42 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.42 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.42 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.42 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  30.89 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  30.65 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7540  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  35.16 
 
 
179 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
176 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
178 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  29.37 
 
 
167 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
197 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  27.13 
 
 
163 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
192 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
198 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
219 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.06 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
185 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  35.04 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
143 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
157 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
163 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  37.33 
 
 
148 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 
140 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
157 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
167 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
148 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>