More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3259 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  336  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  54.67 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  48.76 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  40.6 
 
 		 201 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.76 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.76 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  30.58 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  30.65 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  28.03 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  30.58 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  33.71 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>