More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2059 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 166 aa  337  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  71.33 
 
 		 168 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  45.06 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  37.93 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  37.58 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  36.61 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34.38 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  34.74 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  39.77 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  39.53 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  37.08 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 213 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 204 aa  51.2  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 197 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  27.43 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  31.14 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  36.67 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>