More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7355 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  38.41 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  37.82 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  37 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  37 
 
 		 171 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  35.48 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  33 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  28.26 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  37.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  37.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  37.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  37.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  37.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  37.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  37.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  37.18 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  34.07 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  34.07 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  34.07 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  34.07 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  34.07 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 172 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  32 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  30.48 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 194 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.07 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  40.96 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  34.41 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  37.29 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  27.94 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  38.89 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  38.89 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  38.89 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  33.77 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  28.07 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>