More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3067 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  71.08 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  71.08 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  71.08 
 
 		 167 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  69.94 
 
 		 165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  70.81 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  70.62 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  59.28 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  55.69 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  52.35 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  52.69 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  51.88 
 
 		 173 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  52.2 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  47.5 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  46.71 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  52.48 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  47.31 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  46.88 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  43.12 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  44.38 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  45.62 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1179  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1206  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.0194653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  33.65 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  42.25 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.38 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1243  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0356088  normal  0.548993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 95 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.38 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 174 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  45.71 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  30.17 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  45.61 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  39.73 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.22 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>