More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2393 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  79.52 
 
 
177 aa  281  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  71.26 
 
 
181 aa  246  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  71.43 
 
 
168 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  68.52 
 
 
177 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  59.26 
 
 
162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  59.26 
 
 
174 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  52.5 
 
 
167 aa  177  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  54.88 
 
 
178 aa  174  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  52.5 
 
 
170 aa  168  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  51.83 
 
 
179 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
207 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  49.38 
 
 
166 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  50.6 
 
 
168 aa  153  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
173 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  51.88 
 
 
166 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  46.63 
 
 
167 aa  144  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  47.02 
 
 
170 aa  141  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  49.06 
 
 
165 aa  140  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  49.69 
 
 
180 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  47.8 
 
 
167 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  47.8 
 
 
165 aa  134  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  47.8 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  47.8 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  45.45 
 
 
185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  47.56 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
189 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
153 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
149 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
166 aa  58.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
155 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.06 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  28.3 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
214 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
148 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
151 aa  55.1  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
148 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
148 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
148 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  27.43 
 
 
141 aa  54.7  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
148 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
148 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
148 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
148 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
148 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
95 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
148 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  50 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  36.36 
 
 
197 aa  54.3  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 
161 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>