More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4106 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  61.31 
 
 
177 aa  201  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  61.96 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  59.26 
 
 
173 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  60.37 
 
 
177 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  58.79 
 
 
168 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  52.47 
 
 
170 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  52.47 
 
 
167 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  51.23 
 
 
166 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 
178 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  54.66 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  53.89 
 
 
168 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
170 aa  150  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  53.66 
 
 
207 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  50.61 
 
 
173 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  48.47 
 
 
179 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  52.2 
 
 
166 aa  138  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  48.24 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  50.63 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  46.91 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  49.69 
 
 
185 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  49.69 
 
 
185 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  49.69 
 
 
167 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  48.73 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  32.16 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  36.2 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  34.81 
 
 
172 aa  62  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  36.42 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
167 aa  61.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  36.57 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  33.82 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
95 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  57.4  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
143 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
146 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  43.02 
 
 
166 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 
178 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  32.89 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  37.08 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
143 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
147 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
158 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
143 aa  52  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  40.95 
 
 
162 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 
170 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 
166 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
162 aa  51.6  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
148 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
148 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
148 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
148 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
148 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
159 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 
166 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 
145 aa  50.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.31 
 
 
146 aa  50.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 
147 aa  50.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>