More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1801 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 162 aa  317  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  59.26 
 
 		 173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 168 aa  191  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  60.62 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  61.11 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  58.02 
 
 		 177 aa  186  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  56.79 
 
 		 179 aa  173  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  56.88 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  58.75 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  54.66 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  54.37 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  56.17 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 173 aa  154  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  50.31 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  50.31 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  44.79 
 
 		 167 aa  133  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  46.54 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  46.88 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  44.87 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  33.97 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  36.26 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  35.64 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  39.81 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  40.51 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.53 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  40.51 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  40.51 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  37.8 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>