More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2276 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  313  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 168 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 		 187 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 		 175 aa  133  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  46.21 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 204 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  47.46 
 
 		 194 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  47.46 
 
 		 194 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  47.46 
 
 		 201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  41.55 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.99 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.99 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  41 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  37.96 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  33.58 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  39.13 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.85 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  43.43 
 
 		 196 aa  63.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  29.86 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  27.78 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  31.4 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>