More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0910 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 169 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 173 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  51.81 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 177 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  54.61 
 
 		 175 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 168 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  40.13 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  27.34 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  34.65 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 145 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 162 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 143 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 155 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 145 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 141 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.66 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  33.03 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2534  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 161 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 148 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  23.31 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 151 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 137 aa  48.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.35 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>