More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2690 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 175 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  69.33 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  56.97 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  55.15 
 
 		 174 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 167 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 167 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  32.09 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.38 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 204 aa  67.4  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  38.83 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  34.4 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.22 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  29.69 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  40.2 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  25.16 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.08 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  30.71 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.21 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  31.03 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  31.03 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  31.03 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  31.03 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  31.03 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  31.03 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  32.8 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  31.03 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  31.03 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  31.03 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  28.67 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>