More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6111 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  47.01 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 177 aa  130  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 175 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30.39 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30.39 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.39 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30.39 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 185 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 175 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.39 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  26.85 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.41 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.41 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  34.21 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 120 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  29.31 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  32.53 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>