More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2122 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  354  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  79.49 
 
 		 170 aa  262  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  83.45 
 
 		 168 aa  258  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  74.39 
 
 		 175 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 177 aa  255  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  77.27 
 
 		 175 aa  250  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  76.13 
 
 		 173 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  46.27 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  27.89 
 
 		 261 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  25.85 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  28.66 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  30.17 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 197 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30.63 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 120 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 180 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  34.41 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2534  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.22 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  24.84 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  31.68 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  28.1 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>