104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7572 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  70.83 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  59.17 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  63.54 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  63.54 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  52.68 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  54.9 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 179 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  46.32 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  41.67 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  44.66 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 189 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  39.58 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  28.93 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  46.55 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  28.7 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  32.1 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  32.65 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.93 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  28.18 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  23.85 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 158 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 161 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  30.91 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  30.38 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.47 
 
 		 305 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.71 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  26.17 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 166 aa  40.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0283  hypothetical protein  26.44 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000125013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  31.11 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>