85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4421 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  32.48 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  28.9 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0550  regulatory protein, MarR  31.22 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0117945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  31.55 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  21.37 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  39.53 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 156 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 138 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  23.4 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 169 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  44 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  28.77 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  37.04 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 153 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 169 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 153 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 170 aa  41.6  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 151 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 153 aa  41.6  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 149 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 151 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 151 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>