More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5077 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  65.22 
 
 		 151 aa  186  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  40.51 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  32.26 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.71 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  27.64 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.04 
 
 		 312 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.28 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  34.83 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 325 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>