223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2270 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  344  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  58.08 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 226 aa  174  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 160 aa  174  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 183 aa  170  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 174 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 186 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  57.04 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  53.59 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  49.44 
 
 		 191 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  48.88 
 
 		 191 aa  158  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 237 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 185 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  59.69 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  60.47 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  59.69 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 169 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  48.92 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  48.39 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  43.61 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  43.61 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.69 
 
 		 148 aa  98.6  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  43.8 
 
 		 183 aa  97.8  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 145 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  36.72 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  37.6 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 148 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 325 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 321 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 326 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 326 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 326 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 326 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  34.02 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  32.47 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 329 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 326 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0791  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.123564  normal  0.0209412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 336 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 315 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>