78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2510 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 179 aa  356  8e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  58.99 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 182 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  52.81 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  53.9 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  52.81 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  55.77 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  57.89 
 
 		 163 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 169 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 226 aa  157  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  57.14 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 237 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  54.2 
 
 		 154 aa  144  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 173 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  32.31 
 
 		 151 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 158 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  40.41 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 160 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  37.25 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  37.01 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 152 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  25 
 
 		 166 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 162 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>