73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1712 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  85.42 
 
 		 148 aa  247  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  80.14 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  80.85 
 
 		 156 aa  223  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  75.89 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 158 aa  199  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  43.65 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 		 167 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 170 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  35.66 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 183 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 226 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 179 aa  83.6  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 172 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  34.38 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  35.09 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  35.14 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 173 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  29.55 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  29.55 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 193 aa  42  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  24.07 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>