253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3730 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  302  8.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 		 150 aa  234  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 		 150 aa  234  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 		 150 aa  234  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 		 150 aa  234  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  77.7 
 
 		 150 aa  234  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  77.7 
 
 		 150 aa  234  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  77.7 
 
 		 150 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  67.79 
 
 		 150 aa  199  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  29.5 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  35.8 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  22.14 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 170 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 190 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.09 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  23 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 321 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  26.67 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  26.67 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  26.67 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  26.67 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  26.44 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  22.43 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  26.67 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  19.71 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  21.9 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  23.74 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  26.05 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>