213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7207 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  280  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  54.01 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  51.45 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  51.45 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  45.26 
 
 		 138 aa  135  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  43.8 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  43.8 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 191 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 177 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  31.76 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  27.01 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  29.63 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  25.23 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  30.43 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 340 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.93 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 340 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 326 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 237 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 309 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  31.43 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  21.37 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 144 aa  43.5  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04625  transcriptional regulator MarR family  33.8 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>